Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
UVSSAQ2YD98 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UVSSAQ2YD98 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UVSSAQ2YD98 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UVSSAQ2YD98 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UVSSAQ2YD98 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UVSSAQ2YD98 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UVSSAQ2YD98 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UVSSAQ2YD98 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UVSSAQ2YD98 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UVSSAQ2YD98 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UVSSAQ2YD98 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UVSSAQ2YD98 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UVSSAQ2YD98 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UVSSAQ2YD98 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UVSSAQ2YD98 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UVSSAQ2YD98 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UVSSAQ2YD98 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UVSSAQ2YD98 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UVSSAQ2YD98 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UVSSAQ2YD98 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UVSSAQ2YD98 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UVSSAQ2YD98 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
UVSSAQ2YD98 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
UVSSAQ2YD98 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UVSSAQ2YD98 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UVSSAQ2YD98 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UVSSAQ2YD98 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UVSSAQ2YD98 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UVSSAQ2YD98 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UVSSAQ2YD98 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UVSSAQ2YD98 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms