Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL38Q2WGJ6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KLHL38Q2WGJ6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL38Q2WGJ6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL38Q2WGJ6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL38Q2WGJ6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL38Q2WGJ6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL38Q2WGJ6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL38Q2WGJ6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL38Q2WGJ6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL38Q2WGJ6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL38Q2WGJ6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL38Q2WGJ6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL38Q2WGJ6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL38Q2WGJ6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL38Q2WGJ6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL38Q2WGJ6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL38Q2WGJ6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL38Q2WGJ6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL38Q2WGJ6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL38Q2WGJ6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL38Q2WGJ6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.1 ms