Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSR1Q2NL82 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSR1Q2NL82 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TSR1Q2NL82 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSR1Q2NL82 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSR1Q2NL82 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSR1Q2NL82 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSR1Q2NL82 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSR1Q2NL82 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSR1Q2NL82 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TSR1Q2NL82 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSR1Q2NL82 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSR1Q2NL82 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TSR1Q2NL82 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSR1Q2NL82 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR1Q2NL82 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR1Q2NL82 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR1Q2NL82 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR1Q2NL82 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR1Q2NL82 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSR1Q2NL82 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSR1Q2NL82 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSR1Q2NL82 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSR1Q2NL82 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSR1Q2NL82 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSR1Q2NL82 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSR1Q2NL82 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSR1Q2NL82 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSR1Q2NL82 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSR1Q2NL82 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSR1Q2NL82 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSR1Q2NL82 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSR1Q2NL82 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSR1Q2NL82 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSR1Q2NL82 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSR1Q2NL82 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSR1Q2NL82 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSR1Q2NL82 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TSR1Q2NL82 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
TSR1Q2NL82 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TSR1Q2NL82 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSR1Q2NL82 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms