Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
KRT24Q2M2I5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KRT24Q2M2I5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KRT24Q2M2I5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KRT24Q2M2I5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KRT24Q2M2I5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KRT24Q2M2I5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KRT24Q2M2I5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KRT24Q2M2I5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KRT24Q2M2I5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KRT24Q2M2I5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KRT24Q2M2I5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KRT24Q2M2I5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
KRT24Q2M2I5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KRT24Q2M2I5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
KRT24Q2M2I5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KRT24Q2M2I5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KRT24Q2M2I5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KRT24Q2M2I5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KRT24Q2M2I5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KRT24Q2M2I5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
KRT24Q2M2I5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KRT24Q2M2I5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KRT24Q2M2I5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KRT24Q2M2I5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KRT24Q2M2I5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KRT24Q2M2I5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KRT24Q2M2I5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KRT24Q2M2I5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KRT24Q2M2I5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KRT24Q2M2I5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KRT24Q2M2I5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KRT24Q2M2I5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KRT24Q2M2I5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KRT24Q2M2I5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
KRT24Q2M2I5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
KRT24Q2M2I5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
KRT24Q2M2I5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
KRT24Q2M2I5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
KRT24Q2M2I5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
KRT24Q2M2I5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32■■■□□ 2.71
KRT24Q2M2I5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32■■■□□ 2.71
KRT24Q2M2I5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
KRT24Q2M2I5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KRT24Q2M2I5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KRT24Q2M2I5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KRT24Q2M2I5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KRT24Q2M2I5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KRT24Q2M2I5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KRT24Q2M2I5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KRT24Q2M2I5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KRT24Q2M2I5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
KRT24Q2M2I5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
KRT24Q2M2I5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KRT24Q2M2I5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KRT24Q2M2I5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KRT24Q2M2I5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
KRT24Q2M2I5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
KRT24Q2M2I5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
KRT24Q2M2I5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
KRT24Q2M2I5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
KRT24Q2M2I5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
KRT24Q2M2I5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
KRT24Q2M2I5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
KRT24Q2M2I5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
KRT24Q2M2I5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
KRT24Q2M2I5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
KRT24Q2M2I5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
KRT24Q2M2I5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
KRT24Q2M2I5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
KRT24Q2M2I5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
KRT24Q2M2I5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
KRT24Q2M2I5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
KRT24Q2M2I5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
KRT24Q2M2I5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
KRT24Q2M2I5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
KRT24Q2M2I5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
KRT24Q2M2I5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
KRT24Q2M2I5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
KRT24Q2M2I5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
KRT24Q2M2I5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
KRT24Q2M2I5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
KRT24Q2M2I5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
KRT24Q2M2I5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
KRT24Q2M2I5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
KRT24Q2M2I5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
KRT24Q2M2I5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
KRT24Q2M2I5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
KRT24Q2M2I5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
KRT24Q2M2I5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
KRT24Q2M2I5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
KRT24Q2M2I5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
KRT24Q2M2I5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
KRT24Q2M2I5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
KRT24Q2M2I5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
KRT24Q2M2I5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
KRT24Q2M2I5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
KRT24Q2M2I5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
KRT24Q2M2I5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
KRT24Q2M2I5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms