Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ODF4Q2M2E3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ODF4Q2M2E3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ODF4Q2M2E3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms