Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIK4Q16099 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIK4Q16099 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIK4Q16099 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GRIK4Q16099 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GRIK4Q16099 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GRIK4Q16099 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRIK4Q16099 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRIK4Q16099 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIK4Q16099 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GRIK4Q16099 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GRIK4Q16099 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GRIK4Q16099 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GRIK4Q16099 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GRIK4Q16099 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GRIK4Q16099 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GRIK4Q16099 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GRIK4Q16099 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GRIK4Q16099 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GRIK4Q16099 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GRIK4Q16099 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GRIK4Q16099 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
GRIK4Q16099 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GRIK4Q16099 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GRIK4Q16099 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIK4Q16099 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIK4Q16099 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIK4Q16099 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIK4Q16099 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIK4Q16099 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIK4Q16099 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIK4Q16099 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIK4Q16099 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIK4Q16099 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIK4Q16099 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIK4Q16099 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIK4Q16099 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIK4Q16099 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIK4Q16099 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIK4Q16099 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIK4Q16099 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIK4Q16099 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIK4Q16099 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIK4Q16099 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIK4Q16099 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIK4Q16099 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIK4Q16099 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIK4Q16099 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
GRIK4Q16099 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GRIK4Q16099 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GRIK4Q16099 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIK4Q16099 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIK4Q16099 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIK4Q16099 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIK4Q16099 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIK4Q16099 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIK4Q16099 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIK4Q16099 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIK4Q16099 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIK4Q16099 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GRIK4Q16099 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
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