Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SCN9AQ15858 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SCN9AQ15858 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SCN9AQ15858 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCN9AQ15858 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCN9AQ15858 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SCN9AQ15858 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
SCN9AQ15858 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SCN9AQ15858 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SCN9AQ15858 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
SCN9AQ15858 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
SCN9AQ15858 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCN9AQ15858 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCN9AQ15858 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCN9AQ15858 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SCN9AQ15858 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCN9AQ15858 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCN9AQ15858 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCN9AQ15858 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCN9AQ15858 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCN9AQ15858 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCN9AQ15858 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SCN9AQ15858 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCN9AQ15858 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCN9AQ15858 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCN9AQ15858 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SCN9AQ15858 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SCN9AQ15858 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SCN9AQ15858 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SCN9AQ15858 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SCN9AQ15858 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SCN9AQ15858 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCN9AQ15858 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCN9AQ15858 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
SCN9AQ15858 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SCN9AQ15858 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCN9AQ15858 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCN9AQ15858 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCN9AQ15858 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCN9AQ15858 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCN9AQ15858 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SCN9AQ15858 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SCN9AQ15858 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCN9AQ15858 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCN9AQ15858 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCN9AQ15858 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SCN9AQ15858 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCN9AQ15858 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCN9AQ15858 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCN9AQ15858 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SCN9AQ15858 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SCN9AQ15858 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SCN9AQ15858 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SCN9AQ15858 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
SCN9AQ15858 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
SCN9AQ15858 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SCN9AQ15858 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SCN9AQ15858 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCN9AQ15858 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SCN9AQ15858 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCN9AQ15858 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCN9AQ15858 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCN9AQ15858 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SCN9AQ15858 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SCN9AQ15858 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SCN9AQ15858 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SCN9AQ15858 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SCN9AQ15858 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SCN9AQ15858 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SCN9AQ15858 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SCN9AQ15858 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SCN9AQ15858 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SCN9AQ15858 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SCN9AQ15858 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SCN9AQ15858 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SCN9AQ15858 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SCN9AQ15858 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SCN9AQ15858 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SCN9AQ15858 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SCN9AQ15858 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SCN9AQ15858 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SCN9AQ15858 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SCN9AQ15858 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SCN9AQ15858 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SCN9AQ15858 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCN9AQ15858 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCN9AQ15858 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCN9AQ15858 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SCN9AQ15858 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SCN9AQ15858 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SCN9AQ15858 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SCN9AQ15858 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SCN9AQ15858 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCN9AQ15858 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCN9AQ15858 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCN9AQ15858 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCN9AQ15858 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCN9AQ15858 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SCN9AQ15858 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SCN9AQ15858 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
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