Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPTX1Q15818 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPTX1Q15818 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPTX1Q15818 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPTX1Q15818 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPTX1Q15818 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPTX1Q15818 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPTX1Q15818 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPTX1Q15818 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPTX1Q15818 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPTX1Q15818 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPTX1Q15818 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPTX1Q15818 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPTX1Q15818 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPTX1Q15818 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPTX1Q15818 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPTX1Q15818 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPTX1Q15818 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPTX1Q15818 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPTX1Q15818 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPTX1Q15818 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPTX1Q15818 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPTX1Q15818 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NPTX1Q15818 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPTX1Q15818 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPTX1Q15818 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NPTX1Q15818 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NPTX1Q15818 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NPTX1Q15818 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPTX1Q15818 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPTX1Q15818 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPTX1Q15818 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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