Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ALX1Q15699 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ALX1Q15699 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ALX1Q15699 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ALX1Q15699 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ALX1Q15699 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ALX1Q15699 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ALX1Q15699 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ALX1Q15699 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALX1Q15699 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALX1Q15699 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALX1Q15699 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALX1Q15699 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALX1Q15699 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ALX1Q15699 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ALX1Q15699 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ALX1Q15699 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ALX1Q15699 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALX1Q15699 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALX1Q15699 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ALX1Q15699 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALX1Q15699 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALX1Q15699 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALX1Q15699 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ALX1Q15699 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ALX1Q15699 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALX1Q15699 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALX1Q15699 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ALX1Q15699 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ALX1Q15699 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALX1Q15699 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALX1Q15699 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALX1Q15699 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ALX1Q15699 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ALX1Q15699 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALX1Q15699 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALX1Q15699 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALX1Q15699 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALX1Q15699 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALX1Q15699 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALX1Q15699 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ALX1Q15699 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALX1Q15699 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALX1Q15699 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALX1Q15699 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ALX1Q15699 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ALX1Q15699 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ALX1Q15699 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ALX1Q15699 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ALX1Q15699 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ALX1Q15699 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
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