Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NFKBIBQ15653 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NFKBIBQ15653 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFKBIBQ15653 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
NFKBIBQ15653 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NFKBIBQ15653 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NFKBIBQ15653 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NFKBIBQ15653 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NFKBIBQ15653 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NFKBIBQ15653 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NFKBIBQ15653 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms