Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX17Q15036 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SNX17Q15036 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNX17Q15036 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNX17Q15036 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNX17Q15036 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNX17Q15036 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
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SNX17Q15036 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNX17Q15036 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNX17Q15036 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
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SNX17Q15036 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
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SNX17Q15036 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
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SNX17Q15036 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
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SNX17Q15036 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX17Q15036 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX17Q15036 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX17Q15036 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX17Q15036 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX17Q15036 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX17Q15036 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX17Q15036 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX17Q15036 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX17Q15036 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SNX17Q15036 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SNX17Q15036 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX17Q15036 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
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