Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCA4Q14CN2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLCA4Q14CN2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCA4Q14CN2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCA4Q14CN2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms