Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCINQ13939 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCINQ13939 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCINQ13939 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCINQ13939 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCINQ13939 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCINQ13939 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCINQ13939 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCINQ13939 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCINQ13939 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCINQ13939 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCINQ13939 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCINQ13939 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCINQ13939 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCINQ13939 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCINQ13939 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCINQ13939 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCINQ13939 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCINQ13939 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCINQ13939 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCINQ13939 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCINQ13939 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCINQ13939 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCINQ13939 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCINQ13939 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCINQ13939 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCINQ13939 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCINQ13939 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCINQ13939 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCINQ13939 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCINQ13939 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCINQ13939 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCINQ13939 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCINQ13939 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCINQ13939 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCINQ13939 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCINQ13939 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCINQ13939 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCINQ13939 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCINQ13939 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCINQ13939 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCINQ13939 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCINQ13939 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCINQ13939 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCINQ13939 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCINQ13939 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCINQ13939 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCINQ13939 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCINQ13939 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCINQ13939 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCINQ13939 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCINQ13939 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCINQ13939 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCINQ13939 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCINQ13939 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCINQ13939 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCINQ13939 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCINQ13939 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCINQ13939 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCINQ13939 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCINQ13939 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCINQ13939 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCINQ13939 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCINQ13939 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCINQ13939 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCINQ13939 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCINQ13939 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCINQ13939 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCINQ13939 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCINQ13939 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCINQ13939 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCINQ13939 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCINQ13939 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCINQ13939 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCINQ13939 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCINQ13939 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCINQ13939 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCINQ13939 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCINQ13939 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCINQ13939 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCINQ13939 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCINQ13939 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCINQ13939 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCINQ13939 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCINQ13939 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCINQ13939 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCINQ13939 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCINQ13939 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCINQ13939 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCINQ13939 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCINQ13939 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCINQ13939 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCINQ13939 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCINQ13939 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCINQ13939 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCINQ13939 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCINQ13939 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCINQ13939 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCINQ13939 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCINQ13939 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
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