Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMC2Q13753 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMC2Q13753 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMC2Q13753 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LAMC2Q13753 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMC2Q13753 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMC2Q13753 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMC2Q13753 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LAMC2Q13753 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMC2Q13753 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMC2Q13753 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMC2Q13753 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMC2Q13753 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LAMC2Q13753 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMC2Q13753 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMC2Q13753 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LAMC2Q13753 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMC2Q13753 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMC2Q13753 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMC2Q13753 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMC2Q13753 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMC2Q13753 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LAMC2Q13753 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAMC2Q13753 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMC2Q13753 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMC2Q13753 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAMC2Q13753 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMC2Q13753 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC2Q13753 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC2Q13753 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC2Q13753 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC2Q13753 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC2Q13753 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC2Q13753 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMC2Q13753 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMC2Q13753 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMC2Q13753 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMC2Q13753 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMC2Q13753 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMC2Q13753 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMC2Q13753 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMC2Q13753 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMC2Q13753 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMC2Q13753 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMC2Q13753 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMC2Q13753 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMC2Q13753 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMC2Q13753 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LAMC2Q13753 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LAMC2Q13753 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LAMC2Q13753 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LAMC2Q13753 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMC2Q13753 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAMC2Q13753 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMC2Q13753 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMC2Q13753 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMC2Q13753 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAMC2Q13753 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMC2Q13753 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMC2Q13753 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAMC2Q13753 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMC2Q13753 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMC2Q13753 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAMC2Q13753 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMC2Q13753 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMC2Q13753 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMC2Q13753 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAMC2Q13753 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMC2Q13753 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAMC2Q13753 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
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