Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP3AQ13472 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP3AQ13472 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP3AQ13472 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP3AQ13472 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP3AQ13472 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP3AQ13472 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP3AQ13472 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP3AQ13472 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP3AQ13472 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP3AQ13472 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP3AQ13472 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP3AQ13472 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP3AQ13472 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP3AQ13472 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP3AQ13472 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP3AQ13472 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP3AQ13472 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP3AQ13472 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP3AQ13472 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP3AQ13472 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP3AQ13472 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP3AQ13472 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP3AQ13472 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP3AQ13472 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP3AQ13472 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TOP3AQ13472 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP3AQ13472 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TOP3AQ13472 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TOP3AQ13472 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
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