Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RLFQ13129 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RLFQ13129 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RLFQ13129 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RLFQ13129 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RLFQ13129 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RLFQ13129 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RLFQ13129 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RLFQ13129 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RLFQ13129 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RLFQ13129 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RLFQ13129 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RLFQ13129 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RLFQ13129 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RLFQ13129 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RLFQ13129 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RLFQ13129 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RLFQ13129 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RLFQ13129 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RLFQ13129 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RLFQ13129 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RLFQ13129 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RLFQ13129 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RLFQ13129 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RLFQ13129 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RLFQ13129 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RLFQ13129 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RLFQ13129 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RLFQ13129 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RLFQ13129 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RLFQ13129 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RLFQ13129 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RLFQ13129 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RLFQ13129 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RLFQ13129 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RLFQ13129 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RLFQ13129 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
RLFQ13129 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RLFQ13129 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RLFQ13129 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
RLFQ13129 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RLFQ13129 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RLFQ13129 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RLFQ13129 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RLFQ13129 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RLFQ13129 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
RLFQ13129 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RLFQ13129 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RLFQ13129 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RLFQ13129 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RLFQ13129 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RLFQ13129 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RLFQ13129 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RLFQ13129 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RLFQ13129 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RLFQ13129 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RLFQ13129 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RLFQ13129 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RLFQ13129 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RLFQ13129 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RLFQ13129 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RLFQ13129 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RLFQ13129 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RLFQ13129 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RLFQ13129 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RLFQ13129 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RLFQ13129 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RLFQ13129 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RLFQ13129 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RLFQ13129 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RLFQ13129 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RLFQ13129 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RLFQ13129 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RLFQ13129 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RLFQ13129 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RLFQ13129 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RLFQ13129 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RLFQ13129 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RLFQ13129 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RLFQ13129 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RLFQ13129 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RLFQ13129 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RLFQ13129 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RLFQ13129 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RLFQ13129 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RLFQ13129 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RLFQ13129 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RLFQ13129 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RLFQ13129 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RLFQ13129 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RLFQ13129 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RLFQ13129 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RLFQ13129 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RLFQ13129 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RLFQ13129 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RLFQ13129 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RLFQ13129 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RLFQ13129 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RLFQ13129 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RLFQ13129 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
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