Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
PRDM2Q13029 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
PRDM2Q13029 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
PRDM2Q13029 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
PRDM2Q13029 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
PRDM2Q13029 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
PRDM2Q13029 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
PRDM2Q13029 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
PRDM2Q13029 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
PRDM2Q13029 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
PRDM2Q13029 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
PRDM2Q13029 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.29■■■■■ 4.52
PRDM2Q13029 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.28■■■■■ 4.52
PRDM2Q13029 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
PRDM2Q13029 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
PRDM2Q13029 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
PRDM2Q13029 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC43.26■■■■■ 4.52
PRDM2Q13029 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
PRDM2Q13029 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
PRDM2Q13029 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
PRDM2Q13029 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
PRDM2Q13029 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
PRDM2Q13029 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
PRDM2Q13029 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
PRDM2Q13029 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
PRDM2Q13029 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
PRDM2Q13029 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
PRDM2Q13029 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC43.22■■■■■ 4.51
PRDM2Q13029 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
PRDM2Q13029 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
PRDM2Q13029 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
PRDM2Q13029 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC43.21■■■■■ 4.51
PRDM2Q13029 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
PRDM2Q13029 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC43.2■■■■■ 4.51
PRDM2Q13029 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC43.2■■■■■ 4.51
PRDM2Q13029 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.51
PRDM2Q13029 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
PRDM2Q13029 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC43.18■■■■■ 4.5
PRDM2Q13029 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC43.18■■■■■ 4.5
PRDM2Q13029 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC43.17■■■■■ 4.5
PRDM2Q13029 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
PRDM2Q13029 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
PRDM2Q13029 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
PRDM2Q13029 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
PRDM2Q13029 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
PRDM2Q13029 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
PRDM2Q13029 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
PRDM2Q13029 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
PRDM2Q13029 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.15■■■■■ 4.5
PRDM2Q13029 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.14■■■■■ 4.5
PRDM2Q13029 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC43.14■■■■■ 4.5
PRDM2Q13029 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
PRDM2Q13029 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
PRDM2Q13029 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC43.13■■■■■ 4.49
PRDM2Q13029 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC43.13■■■■■ 4.49
PRDM2Q13029 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.49
PRDM2Q13029 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
PRDM2Q13029 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
PRDM2Q13029 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
PRDM2Q13029 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
PRDM2Q13029 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
PRDM2Q13029 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
PRDM2Q13029 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
PRDM2Q13029 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
PRDM2Q13029 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
PRDM2Q13029 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
PRDM2Q13029 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC43.09■■■■■ 4.49
PRDM2Q13029 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
PRDM2Q13029 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
PRDM2Q13029 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
PRDM2Q13029 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
PRDM2Q13029 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
PRDM2Q13029 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
PRDM2Q13029 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
PRDM2Q13029 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
PRDM2Q13029 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
PRDM2Q13029 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
PRDM2Q13029 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
PRDM2Q13029 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
PRDM2Q13029 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
PRDM2Q13029 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
PRDM2Q13029 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
PRDM2Q13029 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
PRDM2Q13029 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
PRDM2Q13029 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
PRDM2Q13029 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
PRDM2Q13029 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC43■■■■■ 4.47
PRDM2Q13029 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
PRDM2Q13029 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
PRDM2Q13029 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
PRDM2Q13029 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
PRDM2Q13029 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
PRDM2Q13029 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
PRDM2Q13029 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
PRDM2Q13029 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
PRDM2Q13029 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
PRDM2Q13029 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
PRDM2Q13029 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
PRDM2Q13029 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
PRDM2Q13029 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC42.95■■■■■ 4.47
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