Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNMA1Q12791 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KCNMA1Q12791 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNMA1Q12791 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
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