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Protein–RNA interactions for Protein: Q12241
VAM3, Syntaxin VAM3, yeast
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283 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
VAM3
Q12241
YBL070C
YBL070C
321 nt
6.15
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
SNT309
YPR101W
528 nt
6.15
□□□□□ -1.42
VAM3
Q12241
AI5_BETA
Q0075
1065 nt
6.14
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
YGR139W
YGR139W
339 nt
6.14
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
YMR074C
YMR074C
438 nt
6.14
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
ARC35
YNR035C
1029 nt
6.14
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
PHO85
YPL031C
918 nt
6.14
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
NUP84
YDL116W
2181 nt
6.14
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
HXT15
YDL245C
1704 nt
6.13
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
HXT16
YJR158W
1704 nt
6.13
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
BRN1
YBL097W
2265 nt
6.13
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
SEC23
YPR181C
2307 nt
6.13
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
MEU1
YLR017W
1014 nt
6.13
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
YPR127W
YPR127W
1038 nt
6.13
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
HRB1
YNL004W
1365 nt
6.13
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
OSM1
YJR051W
1506 nt
6.13
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
VMA2
YBR127C
1554 nt
6.13
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
SKP1
YDR328C
585 nt
6.12
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
EFM1
YHL039W
1758 nt
6.12
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
CYB2
YML054C
1776 nt
6.12
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
EEB1
YPL095C
1371 nt
6.12
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
RPL43A
YPR043W
279 nt
6.12
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
MSI1
YBR195C
1269 nt
6.12
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
TFC6
YDR362C
2019 nt
6.11
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
NSE5
YML023C
1671 nt
6.11
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
MPA43
YNL249C
1629 nt
6.11
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
CYC8
YBR112C
2901 nt
6.11
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
TIF2
YJL138C
1188 nt
6.11
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
YJL213W
YJL213W
996 nt
6.11
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
TIF1
YKR059W
1188 nt
6.11
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
HST2
YPL015C
1074 nt
6.11
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
AMN1
YBR158W
1650 nt
6.1
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
PGI1
YBR196C
1665 nt
6.1
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
TDP1
YBR223C
1635 nt
6.1
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
CMR1
YDL156W
1569 nt
6.1
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
YFL052W
YFL052W
1398 nt
6.1
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
NPL6
YMR091C
1308 nt
6.1
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
YDR401W
YDR401W
564 nt
6.1
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
EDC2
YER035W
438 nt
6.1
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
NMA2
YGR010W
1188 nt
6.1
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
PIL1
YGR086C
1020 nt
6.1
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
NCA3
YJL116C
1014 nt
6.1
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
CCW12
YLR110C
402 nt
6.1
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
RQC1
YDR333C
2172 nt
6.1
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
PET117
YER058W
324 nt
6.09
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
YGL081W
YGL081W
963 nt
6.09
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
NTG1
YAL015C
1200 nt
6.09
□□□□□ -1.43
VAM3
Q12241
MKK1
YOR231W
1527 nt
6.09
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
HXT2
YMR011W
1626 nt
6.08
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
FZF1
YGL254W
900 nt
6.08
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
MIX17
YMR002W
471 nt
6.08
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
SWP1
YMR149W
861 nt
6.08
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
TAH11
YJR046W
1815 nt
6.08
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
TKL2
YBR117C
2046 nt
6.08
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
RSP5
YER125W
2430 nt
6.07
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
YLR358C
YLR358C
564 nt
6.07
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
SDH8
YBR269C
417 nt
6.07
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
ERG27
YLR100W
1044 nt
6.06
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
ENP1
YBR247C
1452 nt
6.06
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
OPT1
YJL212C
2400 nt
6.06
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
DLD1
YDL174C
1764 nt
6.06
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
ATF1
YOR377W
1578 nt
6.06
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
ERS1
YCR075C
783 nt
6.05
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
DOC1
YGL240W
753 nt
6.05
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
THR1
YHR025W
1074 nt
6.05
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
RPL2B
YIL018W
765 nt
6.05
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
KAE1
YKR038C
1161 nt
6.05
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
RRN10
YBL025W
438 nt
6.05
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
LDB19
YOR322C
2457 nt
6.05
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
CIT2
YCR005C
1383 nt
6.05
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
IRC5
YFR038W
2562 nt
6.05
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
GAA1
YLR088W
1845 nt
6.04
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
CLN1
YMR199W
1641 nt
6.04
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
HBN1
YCL026C-B
582 nt
6.04
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
HXK2
YGL253W
1461 nt
6.03
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
MRPL28
YDR462W
444 nt
6.03
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
RIX7
YLL034C
2514 nt
6.03
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
MSG5
YNL053W
1470 nt
6.02
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
YBR241C
YBR241C
1467 nt
6.02
□□□□□ -1.44
VAM3
Q12241
CEM1
YER061C
1329 nt
6.02
□□□□□ -1.45
VAM3
Q12241
PAM17
YKR065C
594 nt
6.02
□□□□□ -1.45
VAM3
Q12241
ATP23
YNR020C
813 nt
6.02
□□□□□ -1.45
VAM3
Q12241
PZF1
YPR186C
1290 nt
6.02
□□□□□ -1.45
VAM3
Q12241
GSH1
YJL101C
2037 nt
6.02
□□□□□ -1.45
VAM3
Q12241
NOG2
YNR053C
1461 nt
6.02
□□□□□ -1.45
VAM3
Q12241
CCT3
YJL014W
1605 nt
6.01
□□□□□ -1.45
VAM3
Q12241
PIH1
YHR034C
1035 nt
6.01
□□□□□ -1.45
VAM3
Q12241
DPM1
YPR183W
804 nt
6.01
□□□□□ -1.45
VAM3
Q12241
POP1
YNL221C
2628 nt
6.01
□□□□□ -1.45
VAM3
Q12241
YAL045C
YAL045C
309 nt
6
□□□□□ -1.45
VAM3
Q12241
OPI11
YPR044C
354 nt
6
□□□□□ -1.45
VAM3
Q12241
SMK1
YPR054W
1167 nt
6
□□□□□ -1.45
VAM3
Q12241
GPH1
YPR160W
2709 nt
5.99
□□□□□ -1.45
VAM3
Q12241
HXT17
YNR072W
1695 nt
5.99
□□□□□ -1.45
VAM3
Q12241
HIS7
YBR248C
1659 nt
5.99
□□□□□ -1.45
VAM3
Q12241
YHR145C
YHR145C
357 nt
5.99
□□□□□ -1.45
VAM3
Q12241
RDN5-2
RDN5-2
119 nt
5.99
□□□□□ -1.45
VAM3
Q12241
RDN5-3
RDN5-3
119 nt
5.99
□□□□□ -1.45
VAM3
Q12241
RDN5-4
RDN5-4
119 nt
5.99
□□□□□ -1.45
VAM3
Q12241
RDN5-5
RDN5-5
119 nt
5.99
□□□□□ -1.45
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