Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LOXL1Q08397 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LOXL1Q08397 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LOXL1Q08397 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LOXL1Q08397 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms