Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DHX9Q08211 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DHX9Q08211 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX9Q08211 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX9Q08211 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DHX9Q08211 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX9Q08211 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX9Q08211 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX9Q08211 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX9Q08211 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX9Q08211 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX9Q08211 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DHX9Q08211 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX9Q08211 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX9Q08211 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX9Q08211 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DHX9Q08211 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX9Q08211 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX9Q08211 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DHX9Q08211 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX9Q08211 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX9Q08211 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DHX9Q08211 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DHX9Q08211 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX9Q08211 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX9Q08211 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX9Q08211 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX9Q08211 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX9Q08211 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX9Q08211 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DHX9Q08211 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX9Q08211 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX9Q08211 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX9Q08211 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX9Q08211 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DHX9Q08211 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX9Q08211 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX9Q08211 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DHX9Q08211 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DHX9Q08211 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DHX9Q08211 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DHX9Q08211 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DHX9Q08211 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DHX9Q08211 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DHX9Q08211 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DHX9Q08211 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms