Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KRTAP1-1Q07627 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRTAP1-1Q07627 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRTAP1-1Q07627 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRTAP1-1Q07627 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRTAP1-1Q07627 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRTAP1-1Q07627 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KRTAP1-1Q07627 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRTAP1-1Q07627 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRTAP1-1Q07627 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRTAP1-1Q07627 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRTAP1-1Q07627 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRTAP1-1Q07627 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRTAP1-1Q07627 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRTAP1-1Q07627 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRTAP1-1Q07627 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRTAP1-1Q07627 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRTAP1-1Q07627 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRTAP1-1Q07627 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRTAP1-1Q07627 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRTAP1-1Q07627 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRTAP1-1Q07627 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRTAP1-1Q07627 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRTAP1-1Q07627 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KRTAP1-1Q07627 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KRTAP1-1Q07627 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRTAP1-1Q07627 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms