Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHRNB3Q05901 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHRNB3Q05901 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms