Protein–RNA interactions for Protein: Q04235

TRM12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM12Q04235 CDC13YDL220C 2775 nt6.74□□□□□ -1.33
TRM12Q04235 GSH1YJL101C 2037 nt6.73□□□□□ -1.33
TRM12Q04235 TRR1YDR353W 960 nt6.73□□□□□ -1.33
TRM12Q04235 REC107YJR021C 945 nt6.73□□□□□ -1.33
TRM12Q04235 LDB7YBL006C 543 nt6.73□□□□□ -1.33
TRM12Q04235 YOR111WYOR111W 699 nt6.73□□□□□ -1.33
TRM12Q04235 SSC1YJR045C 1965 nt6.73□□□□□ -1.33
TRM12Q04235 ADE5,7YGL234W 2409 nt6.72□□□□□ -1.33
TRM12Q04235 MRPL28YDR462W 444 nt6.72□□□□□ -1.33
TRM12Q04235 CCT3YJL014W 1605 nt6.72□□□□□ -1.33
TRM12Q04235 STF1YDL130W-A 261 nt6.71□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 FIT2YOR382W 462 nt6.71□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 HBN1YCL026C-B 582 nt6.71□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 RPL2BYIL018W 765 nt6.7□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 MEU1YLR017W 1014 nt6.7□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 RPL31BYLR406C 342 nt6.7□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 SPG5YMR191W 1122 nt6.7□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 YPR076WYPR076W 375 nt6.7□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 YBR241CYBR241C 1467 nt6.7□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 MSB3YNL293W 1902 nt6.69□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 CYS4YGR155W 1524 nt6.69□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 PUS7YOR243C 2031 nt6.69□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 ICP55YER078C 1536 nt6.68□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 AGX1YFL030W 1158 nt6.68□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 MSC3YLR219W 2187 nt6.68□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 MRPS28YDR337W 861 nt6.67□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 YGL102CYGL102C 429 nt6.67□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 VBA5YKR105C 1749 nt6.67□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 NUP49YGL172W 1419 nt6.67□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 COX15YER141W 1461 nt6.66□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 YLL066CYLL066C 3618 nt6.66□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 TRS31YDR472W 852 nt6.66□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 CBR1YIL043C 855 nt6.66□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 PRI1YIR008C 1230 nt6.66□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 RRN10YBL025W 438 nt6.66□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 PPH21YDL134C 1110 nt6.65□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 URH1YDR400W 1023 nt6.65□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 LIA1YJR070C 978 nt6.65□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 HOC1YJR075W 1191 nt6.65□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.65□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.65□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.65□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.65□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 YNR014WYNR014W 639 nt6.65□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 SEC62YPL094C 825 nt6.65□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 SMK1YPR054W 1167 nt6.65□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 SMX3YPR182W 261 nt6.65□□□□□ -1.34
TRM12Q04235 TUF1YOR187W 1314 nt6.65□□□□□ -1.35
TRM12Q04235 SLA2YNL243W 2907 nt6.65□□□□□ -1.35
TRM12Q04235 ICL2YPR006C 1728 nt6.64□□□□□ -1.35
TRM12Q04235 PTC7YHR076W 1032 nt6.64□□□□□ -1.35
TRM12Q04235 PAC2YER007W 1557 nt6.64□□□□□ -1.35
TRM12Q04235 FCY22YER060W-A 1593 nt6.64□□□□□ -1.35
TRM12Q04235 GPD1YDL022W 1176 nt6.63□□□□□ -1.35
TRM12Q04235 YJL045WYJL045W 1905 nt6.63□□□□□ -1.35
TRM12Q04235 GUT1YHL032C 2130 nt6.62□□□□□ -1.35
TRM12Q04235 COX16YJL003W 357 nt6.62□□□□□ -1.35
TRM12Q04235 YLL056CYLL056C 897 nt6.62□□□□□ -1.35
TRM12Q04235 OPI11YPR044C 354 nt6.62□□□□□ -1.35
TRM12Q04235 ASR1YPR093C 867 nt6.62□□□□□ -1.35
TRM12Q04235 CRH1YGR189C 1524 nt6.61□□□□□ -1.35
TRM12Q04235 RGD2YFL047W 2145 nt6.61□□□□□ -1.35
TRM12Q04235 FMP40YPL222W 2067 nt6.61□□□□□ -1.35
TRM12Q04235 DOT1YDR440W 1749 nt6.59□□□□□ -1.35
TRM12Q04235 EDC3YEL015W 1656 nt6.59□□□□□ -1.35
TRM12Q04235 PPH22YDL188C 1134 nt6.59□□□□□ -1.35
TRM12Q04235 MRPL35YDR322W 1104 nt6.59□□□□□ -1.35
TRM12Q04235 SRY1YKL218C 981 nt6.59□□□□□ -1.35
TRM12Q04235 OPI8YKR035C 642 nt6.58□□□□□ -1.36
TRM12Q04235 LSC1YOR142W 990 nt6.58□□□□□ -1.36
TRM12Q04235 CMK2YOL016C 1344 nt6.57□□□□□ -1.36
TRM12Q04235 HED1YDR014W-A 489 nt6.57□□□□□ -1.36
TRM12Q04235 YSC83YHR017W 1158 nt6.57□□□□□ -1.36
TRM12Q04235 YKL077WYKL077W 1179 nt6.57□□□□□ -1.36
TRM12Q04235 MRPL19YNL185C 477 nt6.57□□□□□ -1.36
TRM12Q04235 RPL5YPL131W 894 nt6.57□□□□□ -1.36
TRM12Q04235 ECM38YLR299W 1983 nt6.57□□□□□ -1.36
TRM12Q04235 CCR4YAL021C 2514 nt6.56□□□□□ -1.36
TRM12Q04235 MIP1YOR330C 3765 nt6.56□□□□□ -1.36
TRM12Q04235 YBR113WYBR113W 483 nt6.56□□□□□ -1.36
TRM12Q04235 BDF2YDL070W 1917 nt6.56□□□□□ -1.36
TRM12Q04235 ARP3YJR065C 1350 nt6.56□□□□□ -1.36
TRM12Q04235 YDL177CYDL177C 513 nt6.55□□□□□ -1.36
TRM12Q04235 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.55□□□□□ -1.36
TRM12Q04235 YKL102CYKL102C 306 nt6.55□□□□□ -1.36
TRM12Q04235 YNL092WYNL092W 1203 nt6.55□□□□□ -1.36
TRM12Q04235 PEX31YGR004W 1389 nt6.55□□□□□ -1.36
TRM12Q04235 HSP12YFL014W 330 nt6.54□□□□□ -1.36
TRM12Q04235 SUR7YML052W 909 nt6.54□□□□□ -1.36
TRM12Q04235 YMR034CYMR034C 1305 nt6.53□□□□□ -1.36
TRM12Q04235 ECM27YJR106W 2178 nt6.53□□□□□ -1.36
TRM12Q04235 LCL3YGL085W 825 nt6.53□□□□□ -1.36
TRM12Q04235 DYS1YHR068W 1164 nt6.53□□□□□ -1.36
TRM12Q04235 IRC11YOR013W 471 nt6.53□□□□□ -1.36
TRM12Q04235 YHR020WYHR020W 2067 nt6.53□□□□□ -1.36
TRM12Q04235 CTF8YHR191C 402 nt6.52□□□□□ -1.37
TRM12Q04235 GCN3YKR026C 918 nt6.52□□□□□ -1.37
TRM12Q04235 RSP5YER125W 2430 nt6.51□□□□□ -1.37
TRM12Q04235 COQ1YBR003W 1422 nt6.51□□□□□ -1.37
TRM12Q04235 STT3YGL022W 2157 nt6.51□□□□□ -1.37
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