Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CENPCQ03188 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CENPCQ03188 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CENPCQ03188 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPCQ03188 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPCQ03188 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPCQ03188 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPCQ03188 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPCQ03188 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPCQ03188 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CENPCQ03188 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CENPCQ03188 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPCQ03188 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPCQ03188 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CENPCQ03188 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPCQ03188 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPCQ03188 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPCQ03188 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPCQ03188 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CENPCQ03188 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPCQ03188 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPCQ03188 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPCQ03188 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPCQ03188 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CENPCQ03188 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPCQ03188 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPCQ03188 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CENPCQ03188 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms