Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
MDM2Q00987 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MDM2Q00987 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MDM2Q00987 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MDM2Q00987 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MDM2Q00987 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MDM2Q00987 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MDM2Q00987 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MDM2Q00987 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
MDM2Q00987 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MDM2Q00987 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MDM2Q00987 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MDM2Q00987 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MDM2Q00987 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MDM2Q00987 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MDM2Q00987 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MDM2Q00987 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MDM2Q00987 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MDM2Q00987 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MDM2Q00987 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MDM2Q00987 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MDM2Q00987 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MDM2Q00987 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MDM2Q00987 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MDM2Q00987 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MDM2Q00987 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MDM2Q00987 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MDM2Q00987 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MDM2Q00987 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MDM2Q00987 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
MDM2Q00987 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
MDM2Q00987 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MDM2Q00987 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MDM2Q00987 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MDM2Q00987 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MDM2Q00987 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MDM2Q00987 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MDM2Q00987 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MDM2Q00987 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MDM2Q00987 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MDM2Q00987 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MDM2Q00987 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MDM2Q00987 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MDM2Q00987 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MDM2Q00987 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MDM2Q00987 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MDM2Q00987 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MDM2Q00987 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MDM2Q00987 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MDM2Q00987 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MDM2Q00987 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MDM2Q00987 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MDM2Q00987 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MDM2Q00987 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MDM2Q00987 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MDM2Q00987 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MDM2Q00987 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MDM2Q00987 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MDM2Q00987 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MDM2Q00987 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MDM2Q00987 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MDM2Q00987 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MDM2Q00987 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MDM2Q00987 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MDM2Q00987 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MDM2Q00987 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MDM2Q00987 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MDM2Q00987 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MDM2Q00987 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MDM2Q00987 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MDM2Q00987 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MDM2Q00987 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MDM2Q00987 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MDM2Q00987 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MDM2Q00987 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MDM2Q00987 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
MDM2Q00987 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MDM2Q00987 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MDM2Q00987 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MDM2Q00987 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms