Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
IRF9Q00978 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IRF9Q00978 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF9Q00978 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms