Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VLDLRP98155 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VLDLRP98155 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VLDLRP98155 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VLDLRP98155 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VLDLRP98155 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VLDLRP98155 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VLDLRP98155 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VLDLRP98155 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VLDLRP98155 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VLDLRP98155 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VLDLRP98155 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VLDLRP98155 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VLDLRP98155 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VLDLRP98155 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VLDLRP98155 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VLDLRP98155 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VLDLRP98155 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VLDLRP98155 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VLDLRP98155 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VLDLRP98155 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VLDLRP98155 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VLDLRP98155 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VLDLRP98155 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VLDLRP98155 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VLDLRP98155 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VLDLRP98155 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VLDLRP98155 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VLDLRP98155 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VLDLRP98155 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VLDLRP98155 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VLDLRP98155 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VLDLRP98155 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VLDLRP98155 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VLDLRP98155 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VLDLRP98155 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VLDLRP98155 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VLDLRP98155 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VLDLRP98155 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VLDLRP98155 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VLDLRP98155 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VLDLRP98155 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VLDLRP98155 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms