Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HTRA4P83105 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HTRA4P83105 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HTRA4P83105 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HTRA4P83105 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HTRA4P83105 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HTRA4P83105 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HTRA4P83105 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HTRA4P83105 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HTRA4P83105 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HTRA4P83105 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HTRA4P83105 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HTRA4P83105 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HTRA4P83105 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HTRA4P83105 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HTRA4P83105 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HTRA4P83105 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HTRA4P83105 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HTRA4P83105 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HTRA4P83105 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HTRA4P83105 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HTRA4P83105 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HTRA4P83105 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HTRA4P83105 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HTRA4P83105 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HTRA4P83105 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HTRA4P83105 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HTRA4P83105 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
HTRA4P83105 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HTRA4P83105 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HTRA4P83105 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HTRA4P83105 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HTRA4P83105 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HTRA4P83105 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HTRA4P83105 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HTRA4P83105 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HTRA4P83105 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HTRA4P83105 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HTRA4P83105 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HTRA4P83105 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HTRA4P83105 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HTRA4P83105 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HTRA4P83105 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HTRA4P83105 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HTRA4P83105 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HTRA4P83105 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HTRA4P83105 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HTRA4P83105 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HTRA4P83105 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HTRA4P83105 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HTRA4P83105 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HTRA4P83105 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HTRA4P83105 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HTRA4P83105 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HTRA4P83105 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HTRA4P83105 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HTRA4P83105 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTRA4P83105 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HTRA4P83105 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTRA4P83105 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HTRA4P83105 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTRA4P83105 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTRA4P83105 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTRA4P83105 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTRA4P83105 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTRA4P83105 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTRA4P83105 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTRA4P83105 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HTRA4P83105 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTRA4P83105 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HTRA4P83105 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HTRA4P83105 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HTRA4P83105 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HTRA4P83105 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HTRA4P83105 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HTRA4P83105 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTRA4P83105 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTRA4P83105 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HTRA4P83105 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HTRA4P83105 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HTRA4P83105 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HTRA4P83105 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HTRA4P83105 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HTRA4P83105 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HTRA4P83105 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HTRA4P83105 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HTRA4P83105 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HTRA4P83105 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HTRA4P83105 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HTRA4P83105 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HTRA4P83105 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTRA4P83105 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTRA4P83105 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTRA4P83105 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTRA4P83105 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTRA4P83105 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTRA4P83105 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HTRA4P83105 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HTRA4P83105 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HTRA4P83105 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms