Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSNK2BP67870 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSNK2BP67870 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSNK2BP67870 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK2BP67870 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms