Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPS29P62273 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPS29P62273 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RPS29P62273 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPS29P62273 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPS29P62273 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPS29P62273 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPS29P62273 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
RPS29P62273 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPS29P62273 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RPS29P62273 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
RPS29P62273 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPS29P62273 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPS29P62273 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPS29P62273 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPS29P62273 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPS29P62273 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPS29P62273 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPS29P62273 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPS29P62273 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
RPS29P62273 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPS29P62273 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPS29P62273 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPS29P62273 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPS29P62273 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPS29P62273 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPS29P62273 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPS29P62273 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPS29P62273 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPS29P62273 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
RPS29P62273 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
RPS29P62273 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
RPS29P62273 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPS29P62273 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
RPS29P62273 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPS29P62273 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPS29P62273 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
RPS29P62273 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPS29P62273 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPS29P62273 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RPS29P62273 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPS29P62273 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPS29P62273 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPS29P62273 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPS29P62273 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
RPS29P62273 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPS29P62273 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
RPS29P62273 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RPS29P62273 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RPS29P62273 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RPS29P62273 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RPS29P62273 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
RPS29P62273 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RPS29P62273 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
RPS29P62273 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
RPS29P62273 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
RPS29P62273 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RPS29P62273 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RPS29P62273 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RPS29P62273 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RPS29P62273 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RPS29P62273 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RPS29P62273 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RPS29P62273 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RPS29P62273 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RPS29P62273 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RPS29P62273 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RPS29P62273 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RPS29P62273 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RPS29P62273 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RPS29P62273 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RPS29P62273 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RPS29P62273 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
RPS29P62273 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RPS29P62273 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RPS29P62273 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RPS29P62273 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RPS29P62273 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RPS29P62273 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RPS29P62273 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RPS29P62273 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RPS29P62273 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RPS29P62273 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RPS29P62273 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RPS29P62273 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RPS29P62273 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RPS29P62273 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RPS29P62273 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RPS29P62273 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RPS29P62273 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RPS29P62273 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RPS29P62273 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RPS29P62273 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RPS29P62273 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RPS29P62273 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RPS29P62273 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RPS29P62273 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RPS29P62273 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RPS29P62273 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RPS29P62273 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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