Protein–RNA interactions for Protein: P61289

PSME3, Proteasome activator complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3P61289 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PSME3P61289 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSME3P61289 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSME3P61289 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSME3P61289 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSME3P61289 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSME3P61289 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSME3P61289 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSME3P61289 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSME3P61289 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PSME3P61289 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSME3P61289 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSME3P61289 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSME3P61289 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSME3P61289 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSME3P61289 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSME3P61289 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSME3P61289 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSME3P61289 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSME3P61289 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSME3P61289 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
PSME3P61289 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME3P61289 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME3P61289 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME3P61289 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME3P61289 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSME3P61289 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSME3P61289 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSME3P61289 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PSME3P61289 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSME3P61289 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSME3P61289 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME3P61289 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME3P61289 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME3P61289 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME3P61289 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME3P61289 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME3P61289 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSME3P61289 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSME3P61289 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSME3P61289 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSME3P61289 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSME3P61289 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSME3P61289 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSME3P61289 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSME3P61289 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSME3P61289 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSME3P61289 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSME3P61289 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSME3P61289 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSME3P61289 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSME3P61289 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSME3P61289 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSME3P61289 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSME3P61289 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PSME3P61289 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSME3P61289 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSME3P61289 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSME3P61289 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSME3P61289 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSME3P61289 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME3P61289 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME3P61289 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME3P61289 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME3P61289 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME3P61289 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME3P61289 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME3P61289 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSME3P61289 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSME3P61289 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSME3P61289 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSME3P61289 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSME3P61289 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSME3P61289 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSME3P61289 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME3P61289 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME3P61289 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSME3P61289 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSME3P61289 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PSME3P61289 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSME3P61289 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME3P61289 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSME3P61289 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME3P61289 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME3P61289 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME3P61289 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME3P61289 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME3P61289 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME3P61289 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME3P61289 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME3P61289 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSME3P61289 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME3P61289 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME3P61289 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME3P61289 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME3P61289 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME3P61289 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME3P61289 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSME3P61289 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSME3P61289 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms