Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACTR3P61158 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTR3P61158 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms