Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GSCP56915 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GSCP56915 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GSCP56915 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GSCP56915 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GSCP56915 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GSCP56915 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GSCP56915 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GSCP56915 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GSCP56915 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GSCP56915 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSCP56915 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSCP56915 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSCP56915 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GSCP56915 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GSCP56915 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GSCP56915 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GSCP56915 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GSCP56915 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GSCP56915 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GSCP56915 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GSCP56915 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GSCP56915 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GSCP56915 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GSCP56915 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GSCP56915 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GSCP56915 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GSCP56915 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GSCP56915 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GSCP56915 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GSCP56915 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GSCP56915 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GSCP56915 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GSCP56915 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GSCP56915 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GSCP56915 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GSCP56915 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GSCP56915 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GSCP56915 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GSCP56915 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GSCP56915 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GSCP56915 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GSCP56915 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GSCP56915 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GSCP56915 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GSCP56915 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GSCP56915 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GSCP56915 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GSCP56915 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GSCP56915 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GSCP56915 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GSCP56915 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GSCP56915 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GSCP56915 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GSCP56915 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GSCP56915 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GSCP56915 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GSCP56915 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GSCP56915 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSCP56915 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSCP56915 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GSCP56915 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSCP56915 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSCP56915 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSCP56915 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSCP56915 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSCP56915 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSCP56915 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSCP56915 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSCP56915 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GSCP56915 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GSCP56915 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GSCP56915 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GSCP56915 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GSCP56915 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GSCP56915 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GSCP56915 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GSCP56915 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GSCP56915 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GSCP56915 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GSCP56915 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GSCP56915 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSCP56915 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSCP56915 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSCP56915 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSCP56915 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSCP56915 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSCP56915 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GSCP56915 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GSCP56915 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GSCP56915 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
GSCP56915 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GSCP56915 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GSCP56915 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GSCP56915 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GSCP56915 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GSCP56915 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GSCP56915 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GSCP56915 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GSCP56915 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms