Protein–RNA interactions for Protein: P56181

NDUFV3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFV3P56181 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFV3P56181 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NDUFV3P56181 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFV3P56181 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFV3P56181 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFV3P56181 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFV3P56181 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFV3P56181 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NDUFV3P56181 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFV3P56181 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFV3P56181 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFV3P56181 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFV3P56181 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFV3P56181 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFV3P56181 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NDUFV3P56181 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms