Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TPTEP56180 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPTEP56180 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPTEP56180 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPTEP56180 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPTEP56180 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPTEP56180 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPTEP56180 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPTEP56180 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPTEP56180 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPTEP56180 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPTEP56180 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPTEP56180 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPTEP56180 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPTEP56180 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPTEP56180 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPTEP56180 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPTEP56180 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TPTEP56180 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPTEP56180 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPTEP56180 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPTEP56180 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPTEP56180 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPTEP56180 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPTEP56180 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TPTEP56180 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPTEP56180 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPTEP56180 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPTEP56180 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TPTEP56180 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPTEP56180 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPTEP56180 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPTEP56180 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPTEP56180 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPTEP56180 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TPTEP56180 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPTEP56180 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTEP56180 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTEP56180 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTEP56180 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTEP56180 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTEP56180 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTEP56180 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTEP56180 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTEP56180 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPTEP56180 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTEP56180 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTEP56180 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTEP56180 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTEP56180 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTEP56180 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPTEP56180 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPTEP56180 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TPTEP56180 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPTEP56180 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPTEP56180 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPTEP56180 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPTEP56180 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPTEP56180 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPTEP56180 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPTEP56180 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPTEP56180 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TPTEP56180 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPTEP56180 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPTEP56180 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPTEP56180 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TPTEP56180 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPTEP56180 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPTEP56180 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPTEP56180 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPTEP56180 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPTEP56180 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPTEP56180 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPTEP56180 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPTEP56180 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPTEP56180 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPTEP56180 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTEP56180 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTEP56180 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTEP56180 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPTEP56180 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTEP56180 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTEP56180 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTEP56180 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTEP56180 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTEP56180 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTEP56180 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTEP56180 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTEP56180 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTEP56180 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPTEP56180 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPTEP56180 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPTEP56180 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPTEP56180 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPTEP56180 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPTEP56180 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPTEP56180 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPTEP56180 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPTEP56180 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPTEP56180 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms