Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMP1P54849 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMP1P54849 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMP1P54849 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EMP1P54849 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMP1P54849 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMP1P54849 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMP1P54849 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMP1P54849 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMP1P54849 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EMP1P54849 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMP1P54849 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMP1P54849 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMP1P54849 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMP1P54849 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMP1P54849 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMP1P54849 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMP1P54849 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMP1P54849 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EMP1P54849 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EMP1P54849 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EMP1P54849 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EMP1P54849 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EMP1P54849 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EMP1P54849 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EMP1P54849 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EMP1P54849 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EMP1P54849 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EMP1P54849 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EMP1P54849 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EMP1P54849 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EMP1P54849 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMP1P54849 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMP1P54849 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EMP1P54849 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMP1P54849 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMP1P54849 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMP1P54849 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMP1P54849 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMP1P54849 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMP1P54849 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EMP1P54849 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EMP1P54849 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EMP1P54849 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EMP1P54849 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EMP1P54849 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EMP1P54849 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EMP1P54849 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EMP1P54849 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMP1P54849 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMP1P54849 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMP1P54849 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMP1P54849 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMP1P54849 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMP1P54849 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EMP1P54849 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EMP1P54849 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMP1P54849 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
EMP1P54849 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMP1P54849 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMP1P54849 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMP1P54849 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMP1P54849 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMP1P54849 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMP1P54849 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMP1P54849 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMP1P54849 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMP1P54849 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMP1P54849 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMP1P54849 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMP1P54849 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMP1P54849 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMP1P54849 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMP1P54849 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMP1P54849 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMP1P54849 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMP1P54849 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMP1P54849 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMP1P54849 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMP1P54849 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMP1P54849 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMP1P54849 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMP1P54849 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMP1P54849 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMP1P54849 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMP1P54849 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMP1P54849 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMP1P54849 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMP1P54849 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EMP1P54849 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMP1P54849 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMP1P54849 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMP1P54849 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMP1P54849 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMP1P54849 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMP1P54849 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMP1P54849 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMP1P54849 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMP1P54849 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMP1P54849 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms