Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKAA2P54646 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKAA2P54646 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAA2P54646 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAA2P54646 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAA2P54646 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAA2P54646 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKAA2P54646 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRKAA2P54646 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRKAA2P54646 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKAA2P54646 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKAA2P54646 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKAA2P54646 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKAA2P54646 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKAA2P54646 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKAA2P54646 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKAA2P54646 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAA2P54646 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAA2P54646 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAA2P54646 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAA2P54646 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKAA2P54646 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAA2P54646 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAA2P54646 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms