Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CLTCL1P53675 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CLTCL1P53675 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CLTCL1P53675 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CLTCL1P53675 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CLTCL1P53675 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CLTCL1P53675 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CLTCL1P53675 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CLTCL1P53675 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CLTCL1P53675 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CLTCL1P53675 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CLTCL1P53675 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CLTCL1P53675 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CLTCL1P53675 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CLTCL1P53675 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CLTCL1P53675 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CLTCL1P53675 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
CLTCL1P53675 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CLTCL1P53675 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CLTCL1P53675 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CLTCL1P53675 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CLTCL1P53675 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CLTCL1P53675 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CLTCL1P53675 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CLTCL1P53675 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CLTCL1P53675 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CLTCL1P53675 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CLTCL1P53675 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CLTCL1P53675 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CLTCL1P53675 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CLTCL1P53675 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CLTCL1P53675 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CLTCL1P53675 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CLTCL1P53675 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CLTCL1P53675 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CLTCL1P53675 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CLTCL1P53675 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CLTCL1P53675 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CLTCL1P53675 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
CLTCL1P53675 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
CLTCL1P53675 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
CLTCL1P53675 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
CLTCL1P53675 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CLTCL1P53675 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CLTCL1P53675 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CLTCL1P53675 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLTCL1P53675 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLTCL1P53675 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLTCL1P53675 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLTCL1P53675 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CLTCL1P53675 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CLTCL1P53675 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CLTCL1P53675 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CLTCL1P53675 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CLTCL1P53675 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CLTCL1P53675 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CLTCL1P53675 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CLTCL1P53675 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CLTCL1P53675 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CLTCL1P53675 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CLTCL1P53675 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CLTCL1P53675 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CLTCL1P53675 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLTCL1P53675 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLTCL1P53675 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLTCL1P53675 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLTCL1P53675 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CLTCL1P53675 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CLTCL1P53675 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CLTCL1P53675 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CLTCL1P53675 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CLTCL1P53675 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CLTCL1P53675 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CLTCL1P53675 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CLTCL1P53675 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CLTCL1P53675 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CLTCL1P53675 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CLTCL1P53675 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CLTCL1P53675 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CLTCL1P53675 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CLTCL1P53675 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CLTCL1P53675 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CLTCL1P53675 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CLTCL1P53675 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CLTCL1P53675 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CLTCL1P53675 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CLTCL1P53675 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CLTCL1P53675 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CLTCL1P53675 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
CLTCL1P53675 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CLTCL1P53675 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CLTCL1P53675 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CLTCL1P53675 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CLTCL1P53675 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CLTCL1P53675 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CLTCL1P53675 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CLTCL1P53675 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLTCL1P53675 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLTCL1P53675 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLTCL1P53675 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms