Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEK4P51957 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEK4P51957 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NEK4P51957 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEK4P51957 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NEK4P51957 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEK4P51957 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEK4P51957 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEK4P51957 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEK4P51957 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEK4P51957 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEK4P51957 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEK4P51957 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEK4P51957 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEK4P51957 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
NEK4P51957 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEK4P51957 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEK4P51957 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NEK4P51957 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEK4P51957 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEK4P51957 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEK4P51957 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEK4P51957 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEK4P51957 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NEK4P51957 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEK4P51957 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEK4P51957 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEK4P51957 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEK4P51957 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEK4P51957 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEK4P51957 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEK4P51957 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEK4P51957 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEK4P51957 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEK4P51957 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEK4P51957 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEK4P51957 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEK4P51957 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NEK4P51957 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEK4P51957 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEK4P51957 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEK4P51957 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEK4P51957 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEK4P51957 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEK4P51957 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEK4P51957 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEK4P51957 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEK4P51957 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEK4P51957 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEK4P51957 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEK4P51957 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NEK4P51957 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEK4P51957 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEK4P51957 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEK4P51957 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEK4P51957 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEK4P51957 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NEK4P51957 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NEK4P51957 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NEK4P51957 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NEK4P51957 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NEK4P51957 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NEK4P51957 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NEK4P51957 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NEK4P51957 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NEK4P51957 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEK4P51957 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NEK4P51957 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEK4P51957 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEK4P51957 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEK4P51957 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEK4P51957 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEK4P51957 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEK4P51957 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEK4P51957 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEK4P51957 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEK4P51957 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEK4P51957 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEK4P51957 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEK4P51957 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEK4P51957 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEK4P51957 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEK4P51957 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEK4P51957 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEK4P51957 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NEK4P51957 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEK4P51957 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEK4P51957 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEK4P51957 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEK4P51957 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEK4P51957 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEK4P51957 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEK4P51957 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEK4P51957 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEK4P51957 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEK4P51957 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEK4P51957 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEK4P51957 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEK4P51957 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEK4P51957 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms