Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RORCP51449 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RORCP51449 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RORCP51449 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RORCP51449 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RORCP51449 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RORCP51449 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RORCP51449 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RORCP51449 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RORCP51449 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RORCP51449 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RORCP51449 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RORCP51449 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RORCP51449 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RORCP51449 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RORCP51449 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RORCP51449 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RORCP51449 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RORCP51449 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RORCP51449 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RORCP51449 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RORCP51449 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RORCP51449 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RORCP51449 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RORCP51449 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RORCP51449 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RORCP51449 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RORCP51449 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RORCP51449 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RORCP51449 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RORCP51449 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RORCP51449 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RORCP51449 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RORCP51449 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RORCP51449 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RORCP51449 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RORCP51449 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RORCP51449 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RORCP51449 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RORCP51449 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RORCP51449 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RORCP51449 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RORCP51449 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RORCP51449 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RORCP51449 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RORCP51449 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RORCP51449 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RORCP51449 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RORCP51449 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RORCP51449 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RORCP51449 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RORCP51449 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RORCP51449 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RORCP51449 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RORCP51449 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RORCP51449 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RORCP51449 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RORCP51449 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RORCP51449 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RORCP51449 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RORCP51449 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RORCP51449 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RORCP51449 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RORCP51449 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RORCP51449 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RORCP51449 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RORCP51449 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RORCP51449 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RORCP51449 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RORCP51449 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RORCP51449 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RORCP51449 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RORCP51449 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RORCP51449 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RORCP51449 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RORCP51449 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RORCP51449 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RORCP51449 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RORCP51449 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RORCP51449 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RORCP51449 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RORCP51449 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RORCP51449 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RORCP51449 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RORCP51449 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RORCP51449 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RORCP51449 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RORCP51449 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RORCP51449 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RORCP51449 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RORCP51449 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RORCP51449 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RORCP51449 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RORCP51449 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RORCP51449 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RORCP51449 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RORCP51449 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RORCP51449 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RORCP51449 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RORCP51449 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms