Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAPOLAP51003 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PAPOLAP51003 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAPOLAP51003 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAPOLAP51003 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAPOLAP51003 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAPOLAP51003 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAPOLAP51003 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PAPOLAP51003 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAPOLAP51003 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAPOLAP51003 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAPOLAP51003 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAPOLAP51003 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAPOLAP51003 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAPOLAP51003 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAPOLAP51003 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAPOLAP51003 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAPOLAP51003 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAPOLAP51003 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PAPOLAP51003 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAPOLAP51003 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAPOLAP51003 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAPOLAP51003 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAPOLAP51003 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAPOLAP51003 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAPOLAP51003 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAPOLAP51003 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAPOLAP51003 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAPOLAP51003 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAPOLAP51003 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAPOLAP51003 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAPOLAP51003 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.8 ms