Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FNTAP49354 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FNTAP49354 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FNTAP49354 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FNTAP49354 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FNTAP49354 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FNTAP49354 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FNTAP49354 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FNTAP49354 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FNTAP49354 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FNTAP49354 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FNTAP49354 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FNTAP49354 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FNTAP49354 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FNTAP49354 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FNTAP49354 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FNTAP49354 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FNTAP49354 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FNTAP49354 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FNTAP49354 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FNTAP49354 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FNTAP49354 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FNTAP49354 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FNTAP49354 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FNTAP49354 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FNTAP49354 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FNTAP49354 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FNTAP49354 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FNTAP49354 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FNTAP49354 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FNTAP49354 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FNTAP49354 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FNTAP49354 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
FNTAP49354 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FNTAP49354 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FNTAP49354 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FNTAP49354 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
FNTAP49354 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FNTAP49354 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FNTAP49354 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FNTAP49354 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FNTAP49354 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FNTAP49354 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FNTAP49354 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FNTAP49354 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FNTAP49354 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FNTAP49354 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FNTAP49354 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FNTAP49354 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FNTAP49354 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FNTAP49354 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FNTAP49354 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FNTAP49354 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNTAP49354 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNTAP49354 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNTAP49354 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNTAP49354 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNTAP49354 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNTAP49354 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FNTAP49354 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FNTAP49354 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FNTAP49354 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FNTAP49354 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FNTAP49354 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FNTAP49354 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FNTAP49354 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FNTAP49354 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNTAP49354 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNTAP49354 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNTAP49354 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNTAP49354 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNTAP49354 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNTAP49354 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FNTAP49354 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FNTAP49354 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FNTAP49354 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FNTAP49354 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FNTAP49354 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FNTAP49354 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FNTAP49354 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNTAP49354 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNTAP49354 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNTAP49354 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNTAP49354 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FNTAP49354 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FNTAP49354 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FNTAP49354 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FNTAP49354 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FNTAP49354 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FNTAP49354 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FNTAP49354 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FNTAP49354 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FNTAP49354 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FNTAP49354 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FNTAP49354 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FNTAP49354 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FNTAP49354 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FNTAP49354 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FNTAP49354 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FNTAP49354 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms