Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNJ1P48048 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNJ1P48048 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNJ1P48048 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNJ1P48048 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNJ1P48048 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNJ1P48048 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNJ1P48048 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNJ1P48048 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNJ1P48048 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNJ1P48048 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNJ1P48048 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNJ1P48048 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNJ1P48048 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNJ1P48048 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNJ1P48048 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNJ1P48048 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNJ1P48048 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNJ1P48048 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNJ1P48048 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNJ1P48048 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNJ1P48048 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNJ1P48048 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNJ1P48048 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNJ1P48048 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
KCNJ1P48048 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KCNJ1P48048 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNJ1P48048 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNJ1P48048 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNJ1P48048 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNJ1P48048 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KCNJ1P48048 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.6 ms