Protein–RNA interactions for Protein: P47804

RGR, RPE-retinal G protein-coupled receptor, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGRP47804 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGRP47804 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RGRP47804 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGRP47804 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RGRP47804 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGRP47804 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGRP47804 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RGRP47804 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGRP47804 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGRP47804 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RGRP47804 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RGRP47804 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RGRP47804 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGRP47804 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RGRP47804 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGRP47804 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RGRP47804 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGRP47804 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RGRP47804 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGRP47804 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGRP47804 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGRP47804 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGRP47804 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RGRP47804 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGRP47804 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGRP47804 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGRP47804 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGRP47804 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGRP47804 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RGRP47804 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGRP47804 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGRP47804 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGRP47804 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGRP47804 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGRP47804 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RGRP47804 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGRP47804 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RGRP47804 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGRP47804 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGRP47804 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGRP47804 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RGRP47804 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGRP47804 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGRP47804 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGRP47804 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGRP47804 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGRP47804 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RGRP47804 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGRP47804 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGRP47804 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGRP47804 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RGRP47804 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGRP47804 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGRP47804 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGRP47804 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGRP47804 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGRP47804 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGRP47804 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGRP47804 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGRP47804 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGRP47804 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGRP47804 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGRP47804 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGRP47804 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGRP47804 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGRP47804 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RGRP47804 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGRP47804 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGRP47804 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGRP47804 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGRP47804 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGRP47804 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGRP47804 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RGRP47804 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RGRP47804 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RGRP47804 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGRP47804 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RGRP47804 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RGRP47804 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RGRP47804 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGRP47804 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGRP47804 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RGRP47804 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGRP47804 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RGRP47804 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGRP47804 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RGRP47804 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RGRP47804 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGRP47804 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGRP47804 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RGRP47804 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGRP47804 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RGRP47804 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGRP47804 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGRP47804 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGRP47804 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGRP47804 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGRP47804 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RGRP47804 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGRP47804 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms