Protein–RNA interactions for Protein: P45985

MAP2K4, Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP2K4P45985 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP2K4P45985 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP2K4P45985 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP2K4P45985 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP2K4P45985 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP2K4P45985 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAP2K4P45985 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAP2K4P45985 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP2K4P45985 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP2K4P45985 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP2K4P45985 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP2K4P45985 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP2K4P45985 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP2K4P45985 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP2K4P45985 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP2K4P45985 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP2K4P45985 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP2K4P45985 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP2K4P45985 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP2K4P45985 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP2K4P45985 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP2K4P45985 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP2K4P45985 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP2K4P45985 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP2K4P45985 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP2K4P45985 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP2K4P45985 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP2K4P45985 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP2K4P45985 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP2K4P45985 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MAP2K4P45985 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MAP2K4P45985 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms