Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRATP43155 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRATP43155 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CRATP43155 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRATP43155 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CRATP43155 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CRATP43155 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRATP43155 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CRATP43155 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRATP43155 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRATP43155 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CRATP43155 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRATP43155 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRATP43155 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRATP43155 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CRATP43155 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRATP43155 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CRATP43155 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CRATP43155 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRATP43155 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRATP43155 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRATP43155 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CRATP43155 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRATP43155 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRATP43155 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRATP43155 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CRATP43155 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRATP43155 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRATP43155 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRATP43155 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRATP43155 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRATP43155 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRATP43155 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CRATP43155 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRATP43155 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRATP43155 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CRATP43155 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CRATP43155 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CRATP43155 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRATP43155 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CRATP43155 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CRATP43155 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRATP43155 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRATP43155 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRATP43155 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRATP43155 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRATP43155 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRATP43155 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRATP43155 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRATP43155 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRATP43155 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRATP43155 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRATP43155 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRATP43155 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRATP43155 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRATP43155 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRATP43155 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRATP43155 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRATP43155 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRATP43155 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRATP43155 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRATP43155 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRATP43155 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRATP43155 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRATP43155 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRATP43155 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRATP43155 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRATP43155 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRATP43155 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRATP43155 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRATP43155 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRATP43155 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRATP43155 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRATP43155 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRATP43155 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRATP43155 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRATP43155 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRATP43155 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRATP43155 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRATP43155 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRATP43155 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRATP43155 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRATP43155 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRATP43155 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CRATP43155 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRATP43155 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRATP43155 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRATP43155 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRATP43155 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRATP43155 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRATP43155 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRATP43155 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRATP43155 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRATP43155 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRATP43155 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRATP43155 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CRATP43155 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CRATP43155 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CRATP43155 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CRATP43155 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.8 ms