Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC1A1P43005 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC1A1P43005 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SLC1A1P43005 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC1A1P43005 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms