Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNFSF9P41273 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNFSF9P41273 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFSF9P41273 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFSF9P41273 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFSF9P41273 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFSF9P41273 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFSF9P41273 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFSF9P41273 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFSF9P41273 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFSF9P41273 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFSF9P41273 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFSF9P41273 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNFSF9P41273 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNFSF9P41273 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNFSF9P41273 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFSF9P41273 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFSF9P41273 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFSF9P41273 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNFSF9P41273 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNFSF9P41273 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNFSF9P41273 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFSF9P41273 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFSF9P41273 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFSF9P41273 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFSF9P41273 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFSF9P41273 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFSF9P41273 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFSF9P41273 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNFSF9P41273 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNFSF9P41273 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TNFSF9P41273 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFSF9P41273 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFSF9P41273 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TNFSF9P41273 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFSF9P41273 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFSF9P41273 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFSF9P41273 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFSF9P41273 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFSF9P41273 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TNFSF9P41273 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNFSF9P41273 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TNFSF9P41273 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNFSF9P41273 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TNFSF9P41273 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNFSF9P41273 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNFSF9P41273 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNFSF9P41273 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNFSF9P41273 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNFSF9P41273 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNFSF9P41273 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNFSF9P41273 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNFSF9P41273 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TNFSF9P41273 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNFSF9P41273 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNFSF9P41273 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNFSF9P41273 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNFSF9P41273 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNFSF9P41273 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TNFSF9P41273 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFSF9P41273 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFSF9P41273 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFSF9P41273 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFSF9P41273 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFSF9P41273 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFSF9P41273 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFSF9P41273 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFSF9P41273 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TNFSF9P41273 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms