Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP8P40818 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP8P40818 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP8P40818 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
USP8P40818 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP8P40818 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP8P40818 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP8P40818 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP8P40818 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP8P40818 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP8P40818 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP8P40818 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP8P40818 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP8P40818 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP8P40818 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP8P40818 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
USP8P40818 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
USP8P40818 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP8P40818 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP8P40818 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP8P40818 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
USP8P40818 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP8P40818 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP8P40818 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP8P40818 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP8P40818 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP8P40818 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP8P40818 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP8P40818 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP8P40818 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP8P40818 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP8P40818 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP8P40818 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
USP8P40818 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
USP8P40818 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP8P40818 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP8P40818 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP8P40818 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP8P40818 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP8P40818 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP8P40818 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP8P40818 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP8P40818 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
USP8P40818 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP8P40818 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP8P40818 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
USP8P40818 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP8P40818 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
USP8P40818 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP8P40818 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP8P40818 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP8P40818 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP8P40818 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP8P40818 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP8P40818 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP8P40818 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP8P40818 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP8P40818 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP8P40818 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
USP8P40818 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP8P40818 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP8P40818 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP8P40818 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP8P40818 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP8P40818 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP8P40818 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP8P40818 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP8P40818 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP8P40818 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP8P40818 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP8P40818 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP8P40818 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP8P40818 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP8P40818 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP8P40818 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP8P40818 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP8P40818 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP8P40818 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP8P40818 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP8P40818 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
USP8P40818 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP8P40818 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP8P40818 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP8P40818 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP8P40818 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP8P40818 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP8P40818 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP8P40818 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP8P40818 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP8P40818 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP8P40818 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP8P40818 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP8P40818 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP8P40818 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP8P40818 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP8P40818 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP8P40818 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP8P40818 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP8P40818 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP8P40818 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms